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【諾貝爾的榮耀-化學桂冠】
2004 貼上標籤步向分解的蛋白 羅時成
塞卡諾渥(Aaron Ciechanover, 1947-)
賀赫希柯(Avram Hershko, 1937-)
羅斯(Irwin Rose, 1926-)
表彰他們發現細胞調控蛋白質分解的相關機制
筆者於1999年發表在《科學月刊》的〈蛋白質的「郵遞區號」〉(參見天下文化出版,
《諾貝爾的榮耀──生理醫學桂冠》,第256頁)一文,敘述布洛柏爾(Gunter Blobel,
1936-)發現蛋白質的「郵遞區號」與獲得諾貝爾生理醫學獎的理由,文末曾提到蛋白
質分解的調控也很重要。未料事隔五年,諾貝爾化學獎頒給了三位生化學家:任職於以
色列科技學院的塞卡諾渥(Aaron Ciechanover, 1947-)、賀赫希柯(Avram Hershko,
1937-),與美國加州大學爾灣分校的羅斯(Irwin Rose, 1926-)。他們因在1978年合
作探討細胞內特殊的蛋白分解方式,提出調控蛋白分解的新機制而獲獎。
細胞學的「中心法則」(central dogma)清楚指出DNA為生物資訊的藍本,此資訊經轉
錄成RNA,再轉譯成蛋白質,經摺疊和剪裁後依蛋白質的「郵遞區號」送到目的地,如
細胞核、細胞膜或粒線體,去執行細胞各種代謝、呈現生命現象。細胞內有成千上萬種
不同的蛋白質,在功能執行完畢後,總不能長生不老,它們和細胞或生物一樣,都得面
對老化與死亡的命運,最後分解成胺基酸。
蛋白質的分解通常需要蛋白的催化,蛋白按其執行功能的位置,可分成細胞外蛋白和細
胞內蛋白。前者如消化道所存在的胃蛋白和胰蛋白,它們在細胞外進行蛋白質的分解,
幫助細胞吸收;後者種類較多,有蛋白質內分解與蛋白質外分解,功能在於促進細胞內
胺基酸的循環使用。有些細胞在電子顯微鏡下,能看到溶體(lysosome),溶體這項特
別的胞器內含各式各樣的蛋白,是細胞用來分解各種老化胞器和大分子(包括蛋白質)
的工具;大部分的蛋白,在酸性(pH 4.8)下的活性最高。
特異的蛋白質分解活性
一般細胞進行小分子合成大分子需要消耗能量(ATP),把大分子分解成小分子則不需
耗能。1977年高爾伯(Goldberg)利用兔子未成熟的紅血球溶解液(reticulocyte
lysate)做蛋白質分解研究時,因為加入ATP抑制劑時觀察到蛋白質分解活性降低,因
而發現一些異常蛋白的分解需要ATP參與,同時這個反應異於溶體內蛋白最佳的酸鹼度
pH 4.8,反倒在pH 7.8時活性最佳。
今年的三位獲獎人中,塞卡諾渥和賀赫希柯於1978年從以色列前往當時在美國費城的羅
斯實驗室,合作研究特異的蛋白分解現象,花了數年功夫提出調控蛋白分解的新機制而
解開謎津,發現這種特殊的蛋白分解方式需要先和泛素(ubiquitin)形成鍵結,然後
才走上分解的不歸路。
泛素最早是在1975年於牛的胸腺細胞中發現的,它是由76個胺基酸組成,起初以為它與
淋巴球的分化過程有關,後來發現除了細菌之外,許多不同組織甚至不同的生物都有泛
素存在,而推翻了它與淋巴球分化有關的假說。有一組科學家發現,泛素除了單獨存在
外,還可以和組織蛋白H2A形成共價鍵,產生所謂的「蛋白質A24」,而這蛋白有兩個胺
基(N)端卻只有一個羧基(C)端,至於組織蛋白與泛素形成共價鍵的生物意義,目前
還不清楚。
在1978年時,三位獲獎人利用紅血球系統,找尋參與這種特異蛋白質分解的成分。他們
首先利用層析法(chromatography),把紅血球的血紅蛋白移除後分成兩部分,這兩部
分分開時毫無分解蛋白的作用,但加在一起就顯示出活性;他們在第一部分找到一個稱
為APF-1(active principle of fraction 1),分子量僅9000且耐熱的蛋白,之後才
知道APF-1就是與組織蛋白H2A形成共價鍵的蛋白,也發現這個蛋白存在於各種真核細胞
和各種不同細胞內,因此統稱作「泛素」。
泛素標示引起蛋白質分解
1980年三位得獎人對泛素如何引起蛋白質分解,有突破性的發現。他們利用具有放射性
的I125標示泛素,並把標示過的泛素混在紅血球的溶解液中,發現有許多蛋白的離胺酸
(lysine)都會與泛素形成共價鍵,更重要的是這次實驗中的蛋白是與多個泛素鍵結,
不像「蛋白質A24」僅與單一個泛素鍵結。
他們也利用免疫沈澱法(immuno-precipitation),找到與泛素一起沈澱、分子量約
450000的複合物。科學家鑑定這個複合物為蛋白體(proteasome),同時也發現另外三
個酵素活性。他們推測這種仰賴ATP的蛋白質分解是需要經過三個酵素活性步驟方能完成
,並提出了「多步驟泛素標示」的假說(multistep ubiquitin-tagging hypothesis)
,也就是所謂「泛素標示引起蛋白質分解」的細胞機制。
這個假說中的三個酵素,分別命名為E1(ubiquitin-activating enzyme)、
E2(conjugating enzyme)和E3(ubiquitin ligase)。首先E1和泛素在水解ATP下產生
鍵結,鍵結的泛素會由E1轉到E2上,E3能辨識將遭分解的蛋白,同時把E2上的泛素轉移
到該蛋白質上,這個反應可重複數次,因此該蛋白經多個泛素標示後,最後轉送到蛋白
體,分解成含7個至9個胺基酸的胜片段。由於三步驟造成蛋白質分解的特性,加上科學
家後來發現在哺乳類細胞內僅有1至2種E1酵素,十來種E2酵素,卻有上百種不同的E3酵
素,因此可以推論E3具有專一性的辨識功用,能辨認各種將遭分解的蛋白質。
一個細胞內大約有三萬個蛋白體,它們的結構為桶狀,蛋白活化區在桶內,蓋子上如同
鑰匙孔般的複合體蛋白可和多泛素標示的蛋白結合,先把泛素切割下來循環使用,並把
剩餘的蛋白引導到桶內分解成胜片段。
一開始時,這三位科學家是利用非完整細胞系統做研究,希望藉此找出這種機制代表的
細胞生理意義。他們利用放射性色胺酸(tryptophan)標示細胞內的蛋白質。泛素不含
此胺基酸,所以當利用抗體沈降泛素時,可以瞭解有多少經色胺酸標示的新合成蛋白質
遭分解,結果顯示新合成的蛋白中有30 %會立刻遭分解,原因可能是這些蛋白摺疊錯誤
,為達到細胞品管蛋白質的效果,於是遭分解回收。
真正瞭解泛素標示引起蛋白質水解的細胞生理意義,是來自一株突變的小鼠細胞株(ts85)
實驗。這是一株溫度敏感的細胞株,它在低溫時生長正常,可是在高溫時因為染色體複製
發生問題,加上一些功能上的差錯,無法進入細胞分裂期,而停止在細胞週期的G2時期;
同時「組織蛋白A24」在高溫時無法偵測到,恢復到低溫時又會出現,顯然把泛素黏到組
織蛋白的酵素,在高溫時不穩定或沒有作用,但在低溫時就恢復功能。後來證實ts85細
胞的E1基因突變了,由此可以進一步瞭解泛素標示不只管控蛋白質的品質,也調控了細
胞週期、染色體的複製以及染色體的結構。
相關的細胞生理意義
有愈來愈多的例子,可以闡明泛素標示所引起蛋白質分解的生理重要性,茲舉例如下:
◎細胞週期
除了在ts85細胞找到E1調控細胞週期的例子之外,也在酵母菌中找到Cdc34蛋白可調控酵
母菌的分裂,此蛋白屬於E2。至於E3參與調控細胞週期最好的例子為
APC(anaphase-promoting complex),APC這個複合酵素體除了促使單純的
Cyclin B與Cdc蛋白複合體中的Cyclin B分解,讓細胞週期進入G1外,主要是管控細胞在
有絲分裂或減數分裂時,染色體會向兩極運動。
細胞分裂時當染色體並排在赤道板上,有一些蛋白質像繩索一樣綁住同源染色體,使其無
法分開,當細胞分裂由中期步入後期,APC會被活化,活化後的APC把一連串的泛素標示在
稱為「後期抑制物」(anaphase inhibitor)的蛋白質上使其步向分解;後期抑制物原本
抑制住一種負責分解蛋白的酵素,抑制物分解後,被活化的酵素會如同利剪,剪開綁住同
源染色體的蛋白質,於是染色體獲得鬆綁,分別移向兩極,形成兩個新細胞核。
若染色體鬆綁有問題,會造成染色體不均勻的配子,會發生自然流產或多了一條第21號染
色體的唐氏症等問題;許多癌細胞都發現染色體個數或套數異常,其成因很可能就是APC
這個E3酵素發生了突變。
◎細胞凋亡和修補染色體
細胞內有一種分子量約53000的蛋白,稱為p53,它是基因體的守護神,同時也是抑癌的大
將。它正常運作時,細胞癌化的機會很低,而人類產生的癌細胞有50%是因為p53基因突變
了。平時p53是透過標示泛素及E3酵素(Mdm2)進行分解,以保持定量。一旦染色體受損,
p53就馬上磷酸化,無法與Mdm2結合走向分解之路。
這使得p53的濃度上升,多餘的p53以轉錄因子的角色開啟了修護染色體的相關基因,進行
染色體修補。若修補不成功則啟動細胞凋亡程式,顯示E3間接扮演調控染色體修補和細胞
凋亡的角色。
公共衛生的調查認為,人類子宮頸癌的產生與人類乳突瘤病毒(HPV)感染有密切關係,
分子層次的機制在於HPV會激活另一個E3酵素(E6-AP)與p53作用,把泛素標示在p53,使
p53分解造成濃度下降。一旦細胞染色體受損,p53因濃度過低無法啟動染色體修補的基因
和細胞凋亡的程式,基因突變遂逐漸累積,最後細胞不死而逐步成為癌細胞。
◎免疫與發炎反應
NF-κB是與免疫及發炎反應相關的轉錄因子。它平時停留在細胞質內,這因為它的抑制蛋
白IκB與它結合,遮住了進入細胞核的「郵遞區號」所以才會停留在細胞質中。一旦細胞
受細菌或病毒感染,啟動了免疫細胞發炎的訊號,把IκB磷酸化,磷酸化的IκB就步上了
泛素標示引起的蛋白質水解途徑。NF-κB鬆脫了束縛,被帶入細胞核啟動發炎反應的基因
,如一些細胞素等。
另外當有病毒侵入細胞後,泛素標示引起的蛋白質水解也會發生作用,把病毒蛋白切成碎
片與MHC-1分子呈現給T淋巴球,激活了T淋巴球,使T淋巴球攻擊受病毒感染的細胞。
除了上述哺乳類細胞的例子之外,植物阻止自花受粉與果蠅眼睛的發育,也受泛素標示引
起的蛋白質分解調控。大多數的開花植物都是雌雄同體,如果以自花授粉來延續後代,會
造成遺傳歧異度的窄化,假以時日容易在某一特殊環境下全部死亡。植物為了避免自花授
粉所帶來滅種的危機,演化出以泛素標示引導蛋白水解的方式來分解同株花粉粒的蛋白,
使之無法受精。其詳細機制尚不十分清楚,不過可以肯定的是,E3參與了這種調控角色。
中研院簡正鼎實驗室研究果蠅眼睛的發育時也發現,E3亦扮演了多重主要角色,包括細胞
的增生、分化與凋亡的調控,更說明了獲獎人的發現呈現在生物學上的普遍性。
結 語
過去科學家研究有關蛋白質的代謝時,多著重於合成,今年三位獲獎人反其道研究蛋白質
如何遭分解,因而打開了一扇大門,使我們瞭解蛋白質分解的調控與許多生命現象息息相
關。有趣的是,他們理應和1999年發現蛋白「郵遞區號」的布洛柏爾一樣,獲生理醫學獎
才對,卻獲得化學獎,這顯示化學與生物醫學的界線是愈來愈不易劃清了!
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